Znanost, ki stoji za sistemi FCU, uporablja temeljna načela fizike, zlasti zakone termodinamike, ki urejajo procese, povezane s prenosom toplote, kot sta prevajanje in konvekcija. Absorpcija toplote poteka skozi tuljavo, ko hladilno sredstvo izhlapi, da se ohladi med načinom hlajenja.
Kar zadeva praktične posledice, ima sistem FCU gibanje zraka in hladiva. V načinu hlajenja zajema toplejši zrak iz tega prostora in ga piha čez tuljavo. Zato hladilno sredstvo zraku odvzema toploto in ga tako ohlaja.
Ta hladen zrak nato ponovno kroži v prostor in ga učinkovito ohladi. Vendar pa je v načinu ogrevanja sprejet obratni postopek. Toplota se odvzame iz hladilnega sredstva skozi tuljavo in prenese na zrak, ki ga segreje, preden se izčrpa nazaj v prostor.